Πρόκειται για τον τομέα της φυσικοθεραπείας ο οποίος αναλαμβάνει την εξασφάλιση της καλύτερης δυνατής αναπνευστικής λειτουργείας, με στόχο την αποτελεσματική διαχείριση των λοιμώξεων και την καλή ποιότητα ζωής των ασθενών.
Πιο συγκεκριμένα, η αναπνευστική φυσικοθεραπεία περιλαμβάνει τεχνικές παροχέτευσης των εκκρίσεων του αναπνευστικού συστήματος, ενδυνάμωση των αναπνευστικών μυών και εκπαίδευση του παιδιού και της οικογένειας στη διαχείριση των εκάστοτε αναπνευστικών δυσκολιών στο σπίτι.
Χρησιμοποιώντας τεχνικές με τα χέρια, θέσεις του σώματος, ασκήσεις εισπνοής-εκπνοής, εκπαίδευση του βήχα, αλλά και σε συνδυασμό με μηχανήματα που μπορεί να έχει προτείνει ο γιατρός (π.χ. cough assist), επιτυγχάνεται ή διατηρείται η καλή υγεία και λειτουργία του αναπνευστικού συστήματος.
Η αναπνευστική φυσικοθεραπεία απευθύνεται σε μεγάλη μερίδα ασθενών, που αντιμετωπίζουν από ήπιες έως πολύ σοβαρές αναπνευστικές δυσκολίες. Για τα παιδιά με σημαντικές νευρολογικές διαταραχές (π.χ. εγκεφαλοπάθεια) η αναπνευστική φυσικοθεραπεία έχει κρίσιμο ρόλο. Εξίσου χρήσιμη είναι όμως και για τα παιδιά με αδυναμία των αναπνευστικών μυών, όπως μπορεί να συμβεί στα νευρομυϊκά νοσήματα ή σε κάποιες μορφές εγκεφαλικής παράλυσης.
Τέλος, οι τεχνικές της αναπνευστικής φυσικοθεραπείας μπορούν να χρησιμοποιηθούν σε παιδιών χωρίς κάποιο άλλο παθολογικό υπόβαθρο, προκειμένου να ανταπεξέλθουν στις περιστασιακές λοιμώξεις του αναπνευστικού συστήματος, και να μειώσουν τις πιθανότητες για χρήση αντιβιοτικών ή δευτερογενών επιπλοκών.